안세회계법인

안녕하세요
공제감면세액에 대한 질문입니다.

(내용)
1. 조세특례제한법 제63조의2 2항에 따라 공장 및 본사를 수도권 밖으로 이전하여 세액감면을 받았습니다.
감면 기간은 본사와 공장 이전일인 2006년부터 2012년 까지였으며, 공장과 본사로 소득구분을 하여 감면받았습니다,
결손 등 사유로 실제 공제감면세액을 받은 기간은 2006년부터 2008년까지 3년 이었습니다. (2009년부터 2012년 까지는 감면세액 없이 계산내역만 제출)

2. 본사가 같이 있던 공장을 매각하고 공장인원 및 제품의 제조품목허가권은 인수하는 회사에서 승계하기로 하였습니다.
본사 및 본사인원은 서울에 있는 지점으로 이전하고자 합니다.

(질문)
1. 본사가 수도권으로 다시 돌아가면 기존의 본사 및 공장의 소득구분에 따라 공제감면세액을 받은 것에 대한 불이익은 없는지요?

2. 불이익이 있다면 범위는 어디까지인지요?